Dự án được ra đời trong bối cảnh ngộ độc thực phẩm vẫn còn xảy ra ở Việt Nam. Một số mặt hàng xuất khẩu trọng yếu của Việt Nam là thực phẩm nông lâm thủy sản vẫn còn bị nước nhập khẩu tiêu hủy, bị gửi trả lại do có vấn đề về an toàn thực phẩm.
Cục trưởng Cục Quản lý Chất lượng nông lâm sản và thủy sản, Bộ NN & PTNT Nguyễn Như Tiệp, cho biết: "Cả 2 chính phủ Việt Nam và Nhật Bản đề ra 3 mục tiêu của dự án là nâng cao năng lực kiểm tra thực phẩm nông thủy sản; Cải tiến Chương trình giám sát quốc gia về an toàn thực phẩm nông thủy sản và Nâng cao năng lực của các cán bộ tham gia chương trình này.
