Dự án sẽ đi qua địa bàn các quận Tây Hồ, Ba Đình, Đống Đa, Cầu Giấy và các huyện Từ Liêm, Hoài Đức, Quốc Oai, Thạch Thất. Hiện Cục Đường sắt Việt Nam đang xin UBND TP có ý kiến thỏa thuận về vị trí, quy mô xây dựng công trình nhằm đảm bảo tính đồng bộ và phù hợp với quy hoạch phát triển của Hà Nội. Đồng thời đưa ra phương án bồi thường, hỗ trợ GPMB đối với đất trong phạm vi hành lang ATGT đường sắt trên 480 tỷ đồng.