Theo Bộ Xây dựng, đến hết năm 2012, ngân sách T.Ư đã phân bổ cho địa phương để thực hiện hỗ trợ hơn 4.254 tỷ đồng, thừa hơn 226 tỷ đồng so với mức hỗ trợ quy định. Tuy nhiên, trên thực tế một số địa phương thừa vốn và một số địa phương bị thiếu vốn để thực hiện. Nguyên nhân chủ yếu là do nhiều địa phương thực hiện không tốt việc điều tra, khảo sát và bình xét đối tượng. Cụ thể, có 17 địa phương chưa được cấp đủ vốn ngân sách T.Ư để thực hiện với tổng số vốn còn thiếu là 37 tỷ đồng và những địa phương được cấp thừa vốn là 263 tỷ đồng (chênh lệch 226 tỷ đồng).