Theo báo cáo của BQLDA xây dựng Bảo tàng Lịch sử Quốc gia, đến nay đã GPMB xong diện tích đất nông nghiệp, chiếm hơn 80% diện tích đất phải thu hồi. Hiện tại, còn gần 10.000m2 đất thổ cư và các công trình kênh mương tưới tiêu nước đang làm các thủ tục đền bù, di chuyển. Trong năm 2012 sẽ cần tối thiểu 105,7 tỷ đồng để triển khai và thanh toán chi phí lập dự án đầu tư và thiết kế theo Hợp đồng đã ký với Công ty Nikken-Sekkei (Nhật Bản), GPMB phần còn lại, chi phí xây dựng hệ thống thoát nước.
Tuy nhiên, trong dự toán ngân sách Nhà nước năm 2012 mà Bộ KH&ĐT thừa ủy quyền của Thủ tướng Chính phủ trình Quốc hội hiện không có danh mục dự án đầu tư xây dựng Bảo tàng Lịch sử Quốc gia và không bố trí vốn cho dự án này.