Theo dự kiến, năm 2013, KTNN sẽ giảm đầu mối kiểm toán so với năm 2012 nhưng chú trọng tăng về quy mô để tập trung nâng cao chất lượng kiểm toán, đặc biệt chú trọng công tác kiểm toán tổng hợp và lồng ghép một số nội dung kiểm toán như: Công tác quản lý và sử dụng đất đai, bất động sản, phát triển nhà và đô thị; khai thác, kinh doanh tài nguyên, khoáng sản. KTNN cũng sẽ tăng cường kiểm toán các đối tượng liên quan đến tái cơ cấu nền kinh tế, đặc biệt là các dự án, công trình phục vụ cho quản lý, điều hành tái cấu trúc đầu tư công; Kiểm toán các tập đoàn kinh tế, các ngân hàng thương mại Nhà nước trong giai đoạn từ năm 2013 đến năm 2015 làm cơ sở cho hoạt động tái cấu trúc DNNN và các ngân hàng thương mại Nhà nước.
