VNACCS/VCIS được phát triển trên cơ sở sử dụng công nghệ của hệ thống thông quan tự động VNACCS/VCIS đang được áp dụng rất thành công tại Nhật Bản. Việc triển khai VNACCS/VCIS sẽ mang lại nhiều lợi ích hơn cho doanh nghiệp như: Thời gian thông quan nhanh hơn, độ chính xác cao hơn, ổn định hơn. Đợt chạy thử hệ thống giúp cho doanh nghiệp và công chức hải quan thực hành sử dụng thành thạo các quy trình nghiệp vụ hải quan trên hệ thống, góp phần giảm thiểu các khó khăn, vướng mắc khi hệ thống vận hành chính thức vào tháng 4/2014.