Theo ông Trần Duy Tạo, trong năm 2013 có 20 dự án đầu tư xây dựng cơ bản các trường ĐH, CĐ được triển khai thực hiện (3 dự án ODA, 3 dự án nhóm A trong nước, 13 dự án nhóm B, 1 dự án nhóm C). Đến nay, đã có 4 dự án chuyển tiếp từ năm 2012 hoàn thành và đưa vào sử dụng trên 110.810m2 xây dựng, tăng thêm diện tích phòng học, phòng thí nghiệm, nhà làm việc các khoa, ký túc xá và nhà luyện tập TDTT. Cùng với đó là hoàn thành 208 trường THCS thuộc Dự án giáo dục THCS vùng khó khăn nhất.
Tuy nhiên, trong quá trình thực hiện, một số đơn vị vi phạm các quy định của nhà nước về quản lý đầu tư và xây dựng. Cụ thể: ĐH Nông nghiệp Hà Nội tự ý phê duyệt và thi công nâng tầng giảng đường đa năng mới, chưa phê duyệt quyết toán dự án hoàn thành, chưa có cơ quan quản lý nhà nước kiểm định sự an toàn công trình. ĐH Xây dựng Hà Nội cho xây dựng tầng hầm thuộc Dự án Giảng đường lớn đa năng nhưng không trình cấp quyết định đầu tư phê duyệt. Một số đơn vị thuê tư vấn quản lý dự án không hiệu quả. Số kinh phí chi cho quản lý dự án rất lớn, nhưng chưa đáp ứng được yêu cầu công việc, gây lãng phí cho ngân sách nhà nước. Công tác đầu thầu tại các đơn vị, hồ sơ vẫn còn thiếu các văn bản căn cứ pháp lý; thực hiện không đầy đủ các nội dung cơ bản trong đấu thầu; một số văn bản do chủ đầu tư phê duyệt bị thiếu hoặc sai sót về nội dung. “Năm 2013, Bộ đã thực hiện phê duyệt quyết toán dự án hoàn thành 30 hạng mục công trình với tổng mức đầu tư 210.619 triệu đồng. Bộ phát hiện cắt giảm các khoản chi không đúng quy định, thu hồi nộp ngân sách nhà nước 18.239 triệu đồng”-ông Duy Tạo thông tin thêm. Với tổng mức vốn đầu tư Bộ GD&ĐT được giao năm 2014 là 625.100 triệu đồng (giảm 11% so với năm 2013), các dự án dự kiến hoàn thành trong năm 2014 và vốn đối ứng cho các dự án ODA theo tiến độ thực hiện sẽ được Bộ ưu tiên bố trí vốn. Song song với đó, Bộ GD&ĐT tập trung bố trí vốn cho các dự án đã hoàn thành trong năm 2013 trở về trước thuộc nhiệm vụ đầu tư từ ngân sách nhà nước nhưng chưa bố trí đủ vốn.