Trong thời gian chờ thành lập, Sở GTVT phối hợp với Quỹ Bảo trì đường bộ T.Ư và các quận, huyện, rà soát nguồn thu phí sử dụng đường bộ và phối hợp với các ngành đôn đốc thu, nộp kịp thời phí sử dụng đường bộ theo quy định. Trong trường hợp nguồn thu phí không đủ cho việc duy tu, bảo dưỡng hạ tầng giao thông, Sở Tài chính phối hợp cùng các ngành tham mưu UBND TP cấp bổ sung kinh phí hàng năm.