Dự kiến, giai đoạn 1 sẽ kiểm tra khí thải xe máy tại 5 thành phố lớn: Hà Nội, TP Hồ Chí Minh, Đà Nẵng, Cần Thơ, Hải Phòng. Loại xe thuộc diện bị kiểm soát khí thải là xe máy trên 10 tuổi, trên 7 tuổi và trên 3 tuổi, tương ứng với thời điểm quy định trên có hiệu lực sau 1 năm, 2 năm và 3 năm, kể từ ngày Chính phủ phê duyệt. Giai đoạn 2, sẽ mở rộng thực hiện đề án ra các thành phố loại 1 và loại 2. Sau khi kiểm tra, xe đạt tiêu chuẩn sẽ được cấp tem và Giấy chứng nhận kiểm tra khí thải định kỳ có thời hạn 1 năm/lần.
Chi phí kiểm định dự kiến là 50.000 đồng/xe/lần. Trong quá trình tham gia giao thông, lực lượng CSGT sẽ xử phạt chủ xe không có tem và Giấy chứng nhận khí thải hoặc có nhưng đã hết hiệu lực với mức phạt 300.000 đồng/lần.