Các trạm thu phí được điều chỉnh gồm: Trạm thu phí Km604+700 và Quán Hàu, tỉnh Quảng Bình; trạm Km763+800, tỉnh Quảng Trị; trạm Km943+975 Quốc lộ 1, tỉnh Quảng Nam; trạm Km1212+550, tỉnh Bình Định. Theo biểu phí mới, mức thu đối với xe tải có tải trọng từ 10 tấn đến dưới 18 tấn; xe chở hàng bằng container 20 fit và xe tải có tải trọng từ 18 tấn trở lên; xe chở hàng bằng container 40 feet được giảm 20.000 đồng/vé/lượt, xuống còn 120.000 đồng và 180.000 đồng/vé/lượt. Các nhóm xe còn lại là xe dưới 12 ghế ngồi, xe tải có tải trọng dưới 2 tấn, các loại xe buýt vận tải khách công cộng; xe từ 12 ghế đến 30 ghế, xe tải có tải trọng từ 2 tấn đến dưới 4 tấn; xe từ 31 ghế ngồi trở lên; xe tải có tải trọng từ 4 tấn đến dưới 10 tấn mức phí là 35.000 đồng; 50.000 đồng và 75.000 đồng/vé/lượt. Bên cạnh đó, Thông tư cũng quy định đối với vé đã in của các nhóm phương tiện thuộc diện điều chỉnh giảm mức thu phí chưa sử dụng hết, đơn vị thu phí báo cáo cơ quan Thuế quản lý trực tiếp và thực hiện đóng dấu mức thu phí mới lên vé đã in. Biểu mức thu phí mới thay thế biểu mức thu tại các Thông tư số 29/2015/TT-BTC; 93/2015/TT-BTC ; 95/2015/TT-BTC; 167/2015/TT-BTC; 192/2015/TT-BTC của Bộ Tài chính quy định mức thu, chế độ thu, nộp, quản lý và sử dụng phí sử dụng đường bộ trạm thu phí tại 5 trạm thu phí nói trên. Mức thu vé lượt mới áp dụng từ 15/9/2016. Mức thu vé tháng, vé quý áp dụng kể từ 1/10/2016.