Theo thỏa thuận được ký kết, người nộp thuế sẽ truy cập trực tiếp vào Cổng thông tin điện tử của Tổng cục Thuế để lập giấy nộp tiền vào ngân sách Nhà nước và tự động gửi tới ngân hàng thương mại xử lý. Dự án được triển khai với 2 giai đoạn. Giai đoạn thí điểm, bắt đầu từ tháng 1/2014, triển khai tối thiểu đến 1.000 doanh nghiệp tại ba địa phương đang thực hiện khai thuế qua mạng là Hà Nội, Bắc Ninh và Vĩnh Phúc; giai đoạn mở rộng được triển khai căn cứ vào kết quả triển khai thí điểm, hai bên tiếp tục phối hợp triển khai mở rộng về số lượng người nộp thuế và địa bàn theo lộ trình của Tổng cục Thuế…
