Đầu tiên BTC tiến hành bốc thăm bảng đấu tại vòng loại, với 4 đội Campuchia, Lào, Đông Timor và Brunei. Ở phần bốc thăm chia bảng vòng chung kết, ĐTVN được bốc thăm vào bảng B. Với kết quả bốc thăm này, ĐTVN không phải gặp Thái Lan, ĐTVN sẽ gặp các đối thủ Malaysia, Myanmar và đội nhất vòng loại. Đây là một kết quả bốc thăm rất may mắn với thây trò HLV Hữu Thắng. Bảng A được coi là bảng đấu "khó" với Indonesia, Singapore và Philippines. Theo quy định, các đội ở bảng A thi đấu ở Myanmar. Trong khi bảng B diễn ra tại Philippines. Dự kiến vòng chung kết sẽ diễn ra từ 19/11 - 17/12. Hai quốc gia Philippines và Myanmar sẽ đồng đăng cai vòng đấu bảng. Ở vòng bảng, các đội thi đấu vòng tròn một lượt để chọn ra hai đội dẫn đầu vào bán kết. Từ vòng bán kết, các đội thi đấu theo thể thức sân nhà và sân khách. Với việc rơi vào bảng đấu nhẹ ký, cơ hội để ĐTVN đi tiếp sẽ có nhiều thuận lợi hơn, nhưng mục tiêu của thầy trò HLV Hữu Thắng chính vào chung kết. Kết quả bốc thăm vòng bảng AFF Cup 2016: Bảng A: Philippines, Thái Lan, Singapore, Indonesia Bảng B: Myanmar, Malaysia, Việt Nam, đội xếp nhất vòng loại
