Dự án được Thủ tướng Chính phủ phê duyệt tại Quyết định số 1591/QĐ-TTg với tổng mức đầu tư là 4.797 tỷ đồng. Tuy nhiên, do biến động về giá vật liệu, phát sinh khối lượng khi triển khai thiết kế kỹ thuật so với hồ sơ thiết kế cơ sở đã được duyệt, bổ sung một số hạng mục công việc chưa có trong tổng mức đầu tư được duyệt năm 2009 như: Cải tạo đường Tôn Thất Đàm, các biện pháp thi công đặc biệt phần ngầm, mái… Trên cơ sở các nguyên tắc điều chỉnh, giá trị tổng mức đầu tư đề nghị được điều chỉnh lại là 6.837 tỷ đồng, tăng thêm 2.040 tỷ đồng.
