Theo đó, Chương trình bao gồm 2 hợp phần: Công trình và phi công trình. Ở hợp phần công trình, chương trình sẽ ưu tiên sửa chữa công trình đầu mối của 1.150 hồ chứa hư hỏng, xuống cấp, nâng cao khả năng chống lũ cho 38 hồ chứa và từng bước nâng cấp hệ thống kênh mương. Hợp phần phi công trình bao gồm hoàn thiện thể chế, chính sách quản lý an toàn đập, quy chuẩn, tiêu chuẩn và định mức kinh tế kỹ thuật về quản lý an toàn đập... Tổng kinh phí cho chương trình là 21.130 tỷ đồng.
