Theo đó, chiều dài tuyến sông Cầu Bây khoảng 7 km, có điểm đầu giao với đường Vành đai 3 (Quốc lộ 1A hiện có), điểm cuối tại vị trí cống Xuân Thụy (thoát ra sông Bắc Hưng Hải).
Trong đó, đoạn từ đường Vành đai 3 (Quốc lộ 1A) đến đường Đông Dư - Dương Xá, quy mô mặt cắt ngang sông rộng 35m. Đoạn từ đường Đông Dư - Dương Xá đến đường từ Khu đô thị Ecopark đi đường 179 (điểm 37), quy mô mặt cắt ngang sông rộng 40m.
Đoạn qua khu vực nghĩa trang nhân dân thôn Đào Xuyên, chùa Đào Xuyên, Nghè Lê Xá chỉ giới sông Cầu Bây được xác định cơ bản theo quy mô sông hiện trạng để tránh cắt qua khu vực nghĩa trang và khu vực di tích, quy mô mặt cắt 25 - 30m. Riêng đoạn tuyến qua khu vực Nghè Lê Xá xây dựng thêm nhánh tuyến mương tiêu phía Đông Nghè Lê Xá, quy mô tuyến mương rộng 10m (phù hợp định hướng quy hoạch phân khu N11).
Đoạn từ điểm 37 (đường Khu đô thị Ecopark đi đường 179) đến cuối tuyến, quy mô mặt cắt ngang sông rộng 43m (phù hợp với Dự án cải tạo, nâng cấp sông Cầu Bây đã được UBND Thành phố phê duyệt tại Quyết định số 5222/QĐ- UBND ngày 20/11/2020).
Về các tuyến đường dọc hai bên sông, đoạn tuyến từ đường Vành đai 3 (Quốc lộ 1A) đến đường Cao tốc Hà Nội - Hải Phòng, xây dựng đường dọc hai bên sông, bao gồm: Tuyến đường phía Đông quy mô rộng 11,5m, gồm lòng đường xe chạy rộng 5,5m, hè hai bên rộng 2x3m. Tuyến đường phía Tây quy mô rộng 13,5m, gồm lòng đường xe chạy rộng 7,5m, hè hai bên rộng 2x3m.
Đoạn từ đường cao tốc Hà Nội - Hải Phòng đến đường Đông Dư - Dương Xá, đoạn tuyến sông qua khu vực có chức năng đất cây xanh Thành phố, đường dọc hai bên tuyến sông sẽ xác định cụ thể theo dự án riêng được cấp thẩm quyền phê duyệt.
Đoạn tuyến từ đường Đông Dư - Dương Xá đến cuối tuyến, xây dựng tuyến đường hai bên sông, cụ thể:
Xây dựng tuyến đường phía Đông (đoạn từ nút giao với tuyến đường quy hoạch 17,5m, đối diện chùa Ngọc Động đến cống Xuân Thụy), quy mô rộng 20,5m gồm: lòng đường xe chạy rộng 10,5m, vỉa hè hai bên rộng 2x5m. Đoạn đầu tuyến từ đường Đông Dư - Dương Xá đến giao với tuyến đường quy hoạch 17,5m (đối điện chùa Ngọc Động) sẽ được nghiên cứu cụ thể theo dự án riêng được cấp thẩm quyền phê duyệt.
Xây dựng tuyến đường phía Tây, quy mô rộng 13,5m, gồm: lòng đường xe chạy rộng 7,5m, vỉa hè hai bên rộng 2x3m. Riêng đoạn tuyến qua khu vực miếu Thuận Tốn xây dựng tuyến đường quy hoạch, quy mô rộng 7m (gồm lòng đường rộng 6m, hè hai bên rộng 2x0,5m) phù hợp với hiện trạng của khu vực, kết nối với đường Đông Dư - Dương Xá.
