Dự án có quy mô 47,2 ha được đầu tư theo 2 giai đoạn (giai đoạn 1 là 19,2 ha). Tổng mức đầu tư giai đoạn 1 (chưa tính mức đầu tư tuyến đường vào) là 781,8 tỷ đồng, dự kiến hoàn thành vào quý IV/2017. Sau khi đi vào hoạt động giai đoạn 1, Cảng thông quan nội địa TP Hà Nội có khả năng tiếp nhận và thông qua 380.000 TEUs/năm (1 TEU tương đương 1 container tiêu chuẩn 20 feet). Trong giai đoạn 2, tổng mức đầu tư dự kiến hơn 1.782 tỷ đồng, dự kiến sẽ hoàn thành trong quý IV/2021, có thể đáp ứng lượng hàng hoá lên tới 760.000 TEUs/năm.
Cảng Thông quan nội địa TP Hà Nội có vị trí thuận lợi, nằm tiếp giáp QL1B, QL5 và Vành đai III của TP, nơi hội tụ các tuyến hành lang vận tải chính của toàn bộ khu vực phía Bắc và các cảng biển, cửa khẩu quốc tế theo chiến lược phát triển 2 hành lang, 1 vành đai kinh tế. Khả năng cung cấp dịch vụ điểm thông quan nội địa này bao gồm: Toàn bộ luồng hàng hóa xuất, nhập khẩu tại khu vực Bắc Việt Nam theo các tuyến hành lang vận tải được trung chuyển qua Hà Nội trước khi đi/đến các cảng biển, cửa khẩu quốc tế tại Hải Phòng, Quảng Ninh, Lạng Sơn, Lào Cai; toàn bộ hàng hóa xuất, nhập khẩu tại các khu kinh tế, khu công nghiệp thuộc các tỉnh, TP nằm trong vùng Thủ đô; Hàng hóa phục vụ cho sự phát triển kinh tế xã hội, hội nhập kinh tế quốc tế của thủ đô Hà Nội nói riêng và toàn vùng kinh tế trọng điểm phía Bắc. 
Sau khi hoàn thành Cảng thông quan mới cũng sẽ cung cấp các dịch vụ kho vận, dịch vụ phụ trợ, logistics, dịch vụ lưu kho (kể cả kho đông lạnh) và phân phối hàng hoá với công nghệ cao, đón đầu xu hướng xuất nhập khẩu không cần kho bãi.
TS Nguyễn Quốc Bình, Chủ tịch HĐTV, Tổng giám đốc Hanel nhận định, việc xây dựng Cảng thông quan nội địa TP Hà Nội là đón đầu cơ hội cho phát triển kinh tế Thủ đô, đồng thời mang lại nguồn thu lớn và ổn định cho ngân sách TP.
Ghi nhận và biểu dương sự cố gắng của các sở, ban, ngành, UBND huyện Gia Lâm, chủ đầu tư đã có nhiều cố gắng để dự án khởi công đúng kế hoạch, Chủ tịch UBND TP Hà Nội Nguyễn Đức Chung tại lễ khởi công cũng nhấn mạnh, với việc triển khai dự án Cảng thông quan nội địa hiện đại cũng sẽ góp phần thực hiện tốt chương trình cải cách hành chính, hiện đại hóa công tác hải quan trên địa bàn TP; Hỗ trợ tối đa cho các DN xuất, nhập khẩu hàng hóa và tạo điều kiện cho sự phát triển các khu công nghiệp trong toàn vùng Thủ đô.
 Lễ khởi công Cảng thông quan nội địa TP Hà Nội sáng 15/5/2016. Ảnh: Anh Quý |
 Khởi công Dự án Thông quan cảng Nội địa TP Hà Nội sáng 15/5/2016. Ảnh: Anh Quý |
 Chủ tịch UBND TP Hà Nội Nguyễn Đức Chung phát biểu tại Lễ khởi công cảng thông quan nội địa TP hà Nội sáng 15/5/2016. Ảnh: Anh Quý |
