Hiện ứng dụng Facebook Messenger đã có sẵn trên Microsoft Store và Mac App Store, cho phép người dùng nhắn tin cho bạn bè và thực hiện các cuộc gọi video, giống như trên các phiên bản di động và web. Nó cũng có chế độ hình nền tối (dark mode).
Thực tế ứng dụng máy tính để bàn độc lập cho Facebook Messenger đã có từ lâu. Bởi những người quản lý Facebook cho rằng ứng dụng Facebook Messenger cho máy tính để bàn sẽ giúp Facebook tham gia sâu hơn vào thị trường công nghệ hội nghị truyền hình - lĩnh vực đang trở nên ngày càng quan trọng trong thời điểm cả xã hội giảm thiểu tương tác trực tiếp do đại dịch Covid-19.
Trong thị trường này, các tên tuổi lớn như Zoom, Skype đang bị chỉ trích vì những vấn đề bảo mật và quyền riêng tư.
Tuy nhiên, thiếu sót lớn nhất của Facebook Messenger hiện tại là nó chỉ cho phép tối đa 8 người tham gia một cuộc gọi video nhóm, trái ngược với 100 hoặc thậm chí 500 trong ứng dụng Zoom.