Cơ quan khí tượng thuỷ văn nhận định dòng chảy trên sông Mê Kông về Đồng bằng sông Cửu Long trong tháng 1,2/2020 có khả năng thiếu hụt từ 10 – 30% so với trung bình nhiều năm và năm 2016. Mực nước Biển Hồ (Campuchia) ở mức thấp, khả năng bổ sung nước cho Đồng bằng sông Cửu Long không nhiều. Từ khoảng giữa tháng 3/2020, lưu lượng dòng chảy về trạm Kratie sẽ tăng. Nguyên nhân là do các hồ xả nước theo quy luật nhiều năm gần đây.
Theo dự báo, tình trạng xâm nhập mặn ở Đồng bằng sông Cửu Long ở mức độ sâu hơn, gay gắt hơn so với trung bình nhiều năm. Trông một số thời điểm, ranh mặn trên các sông có khả năng xâm nhập tương đương mùa khô năm 2015 – 2016.
Thời gian xâm nhập mặn cao nhất trên sông Cửu Long tập trung vào tháng 1,2/2020, trong đó, cần lưu ý giai đoạn từ 21 – 28/1/2020. Riêng các sông Vàm Cỏ, sông Cái Lớn, xâm nhập mặn diễn ra mạnh nhất vào cuối tháng 3/2020.
Đặc biệt, cơ quan khí tượng thuỷ văn Quốc gia nhận định trong trường hợp cực đoan, thời gian thiếu mưa kéo dài kết hợp với việc sử dụng và khai thác tài nguyên nước trong lưu vực (tăng sử dụng nước trên các dòng nhánh và trữ nước tại các đập Trung Quốc) sẽ làm cho tình trạng hạn hán, thiếu nước, xâm nhập mặn trở nên trầm trọng hơn mùa khô năm 2015 – 2016.
