Việc xác định thời điểm bốc thăm VCK U16 và U19 châu Á 2020 được AFC căn cứ vào những diễn biến khả quan trong cuộc chiến chống dịch COVID-19 tại các quốc gia trong châu lục. AFC cũng hi vọng hai đấu trường quan trọng dành cho bóng đá trẻ châu Á sẽ diễn ra theo đúng kế hoạch dự kiến. Cụ thể, VCK U16 châu Á 2020 sẽ diễn ra từ ngày 16/9 đến 3/10/2020 tại Bahrain trong khi VCK U19 châu Á 2020 sẽ được tổ chức từ ngày 14/10 đến 31/10/2020 tại Uzbekistan.
Trong hành trình tại vòng loại, ĐT U16 Việt Nam đã để mất suất vé dự VCK một cách đầy tiếc nuối khi thua ngược 1-2 trước U16 Australia và để mất ngôi đầu về tay chính đối thủ. Do bảng đấu của U16 Việt Nam gồm có 5 đội nên kết quả với đội xếp cuối là U16 Macau không được tính, dẫn đến rủi ro khi cạnh tranh suất vé dành cho 4 đội xếp thứ nhì có thành tích tốt nhất trong các bảng. Điều này đã xảy ra khi ở trận đấu cuối cùng của vòng loại, chỉ cần trận đấu giữa U16 Oman và U16 Ả Rập Xê Út ở bảng D không có kết quả hòa, U16 Việt Nam sẽ giữ được tấm vé vớt cuối cùng. Thế nhưng, kịch bản mà HLV Đinh Thế Nam và các học trò mong đợi đã không xảy ra khi U16 Oman và U16 Ả Rập Xê Út chia điểm trong trận hòa với tỉ số 0-0. U16 Oman giành tổng cộng 7 điểm và đẩy U16 Việt Nam khỏi nhóm bốn đội nhì bảng có thành tích tốt nhất. Cũng bởi vậy mà U16 Việt Nam hụt mất tấm vé dự VCK U16 châu Á 2020 đầy tiếc nuối. Đồng cảnh ngộ với U16 Việt Nam, U16 Thái Lan cũng được 6 điểm và hiệu số +8 và cũng chỉ đứng thứ 6 ở danh sách các đội nhì do đó không thể vượt qua vòng loại. Ở khu vực Đông Nam Á, duy nhất U16 Indonesia là đội đoạt vé dự VCK U16 châu Á 2020.
Ở đấu trường U19 châu Á, ĐT U19 Việt Nam do HLV Philippe Troussier dẫn dắt nằm cùng bảng đấu với Nhật Bản, Mông Cổ và Guam tại Vòng loại. Đội giành chiến thắng 3-0 trước Mông Cổ, 4-1 trước Guam và chia điểm với tỷ 0-0 với Nhật Bản. Cùng được 7 điểm, nhưng U19 Việt Nam phải nhường ngôi đầu bảng cho đội bóng xứ mặt trời mọc do kém hơn về hiệu số bàn thắng bại. Tuy vậy, kết quả này đủ để giúp thầy trò HLV Philippe Troussier trở thành 1 trong 4 đội đứng nhì có thành tích tốt nhất, qua đó, giành vé dự VCK.
Theo phân loại hạt giống để bốc thăm VCK U19 châu Á 2020 của AFC, ĐT U19 Việt Nam nằm ở nhóm hạt giống thứ ba cùng với Malaysia, Iraq và Campuchia. Nhóm hạt giống số 1 gồm: Uzbekistan (chủ nhà VCK), Saudi Arabia, Hàn Quốc, Qatar. Nhóm hạt giống số 2 gồm: Nhật Bản, Tajikistan, Australia, Indonesia. Nhóm hạt giống số 4 gồm: Iran, Yemen, Bahrain và Lào.
Theo công bố của FIFA, châu Á sẽ có tổng cộng 5 suất vé tham dự VCK FIFA U20 World Cup 2021. Ngoại trừ Indonesia được đặc cách vào thẳng trên cương vị là quốc gia đăng cai tổ chức, 4 suất vé còn lại sẽ được xác định sau cuộc đua tại VCK U19 châu Á 2020.
Do Indonesia được vào thẳng VCK FIFA U20 World Cup 2021 nên trong trường hợp đội bóng xứ vạn đảo lọt vào bán kết VCK U19 châu Á 2020, AFC sẽ phải tổ chức thêm một vòng play-off để trao suất vé thứ năm cho 1 trong 4 đội thua tại Tứ kết.
