Theo đó, ông Liêm bị kỷ luật với hình thức giáng chức từ giám đốc xuống phó giám đốc BV vì đã vi phạm pháp luật bị Toà án Nhân dân TP Hà Nội xử phạt cảnh cáo do phạm tội "Thiếu trách nhiệm gây hậu quả nghiêm trọng" theo bản án số 86/2014/HSST ngày 7/3/2014. Trước đó, Cơ quan Cảnh sát điều tra, Công an TP Hà Nội xác định, ông Nguyễn Trí Liêm thiếu trách nhiệm gây hậu quả nghiêm trọng. Cụ thể, dù quy định của Bộ Y tế, của BV đối với công tác tại Khoa Xét nghiệm rất cụ thể nhưng trong quá trình điều hành, ông Liêm đã chỉ đạo các khoa nghiệp vụ tăng cường các xét nghiệm đối với bệnh nhân cận lâm sàng để tăng thu nhập cho BV (BV hưởng 30% số tiền BHYT). Trong thời gian từ ngày 1/7/2012 - 31/5/2013, có 1.544 kết quả xét nghiệm huyết học trùng. Trong đó, 789 kết quả được thống kê vào BHYT và trực tiếp thu của bệnh nhân không có BHYT là 16,569 triệu đồng (21.000 đồng/kết quả).