Cụ thể, điểm chuẩn vào lớp 6 Trường THPT chuyên Hà Nội - Amsterdam được hạ 0,5 điểm so với mức điểm tuyển sinh đợt 1, còn 17 điểm. Còn trường hạ nhiều điểm nhất là THCS Thanh Xuân từ 12,7 còn 11 điểm. Trường hạ ít điểm nhất là THCS Trưng Vương - Hoàn Kiếm với 0,9 điểm - từ 11,05 còn 10,6.
Sở GD&ĐT hướng dẫn các trường căn cứ vào điểm chuẩn trúng tuyển bổ sung, Hiệu trưởng trường THPT chuyên Hà Nội-Amsterdam và 6 trường THCS giảng dạy chương trình thí điểm đào tạo song bằng tổ chức tiếp nhận học sinh trúng tuyển bổ sung theo Quy chế tuyển sinh của Bộ GDĐT và Hướng dẫn tuyển sinh của Sở GDĐT Hà Nội.Thời gian tuyển sinh bổ sung theo lịch tuyển sinh vào lớp 6 chương trình song bằng năm học 2019-2020.
Trước đó, thí sinh tham gia dự tuyển vào trường phải tham gia qua vòng sơ tuyển của hệ THCS bằng cách vượt qua vòng kiểm tra, đánh giá năng lực ở kỳ thi tuyển sinh lớp 6.Ở vòng 2 này, các thí sinh sẽ phải trải qua 3 bài kiểm tra đánh giá năng lực các môn Toán, Tiếng Việt và Tiếng Anh theo hình thức trắc nghiệm kết hợp tự luận.Trường xét tổng điểm của 3 bài kiểm tra và tính từ cao xuống thấp. Năm 2019, chỉ tiêu tuyển sinh lớp 6 của này là 200 học sinh.
