Cụ thể, tại khu đô thị trung tâm sẽ xây dựng mới các bến xe khách gồm: Bến xe Yên Nghĩa (quận Hà Đông) diện tích khoảng 7ha, bến xe phía Đông Bắc (Cổ Bi, huyện Gia Lâm) diện tích khoảng 8 - 10ha, bến xe phía Nam (Ngọc Hồi, huyện Thanh Trì) diện tích khoảng 11ha, bến xe Đông Anh diện tích khoảng 5,3ha, bến xe phía Tây (huyện Quốc Oai) diện tích khoảng 5 - 7ha, bến xe phía Bắc (Nội Bài) diện tích khoảng 5 - 7ha. Tại khu đô thị vệ tinh sẽ xây dựng mới các bến xe khách gồm: Bến xe Phú Xuyên diện tích khoảng 5ha, bến xe Xuân Mai diện tích khoảng 5ha, bến xe Nam Hòa Lạc diện tích khoảng 5ha, bến xe Bắc Hòa Lạc diện tích khoảng 5ha, bến xe Sơn Tây 2 diện tích khoảng 5ha, bến xe Nam Sóc Sơn diện tích khoảng 5ha, bến xe Bắc Sóc Sơn diện tích khoảng 5ha Bên cạnh đó, nâng cấp cải tạo một số bến xe hiện có gồm: Mỹ Đình, Nước Ngầm, Giáp Bát, Gia Lâm, Thường Tín. Xây dựng một sô bến xe khách trong giai đoạn trung hạn tại các khu vực: Phía Nam (Nam Vành đai 3, phường Yên Sở, quận Hoàng Mai diện tích khoảng 3,4ha); phía Tây (khu vực Nam quốc lộ 32, Xuân Phương, huyện Từ Liên, diện tích khoảng 3 - 5ha), phía Bắc (khu vực Vân Trì và Hải Bối, huyện Đông Anh, diện tích khoảng 3 - 5ha). Ngoài bến xe khách, các bến xe tải hiện có sẽ từng bước được di chuyến ra khu vực ngoài đường Vành đai 3 và chuyển đổi đất của các bến xe này phục vụ giao thông công cộng. Mỗi đô thị vệ tinh sẽ xây dựng mới một bến xe tải.
