Mặc dù khối lượng thu, chi tiền mặt rất lớn, khoảng gần 200.000 tỷ đồng/năm, nhưng nhiều năm qua trên toàn hệ thống không để xảy ra trường hợp nhầm lẫn, mất tiền. Bằng các biện pháp nghiệp vụ, biện pháp quản lý, tăng cường sử dụng hệ thống kiểm tra, kiểm soát nội bộ đã giúp các đơn vị KBNN phát hiện và ngăn chặn các sai sót có thể xảy ra, tạo được lòng tin và sự tín nhiệm đối với khách hàng và nhân dân đến giao dịch.