Nha Trang sở hữu nhiều hòn đảo xinh đẹp với nhiều rặng san hô cũng như với nhiều loài cá phong phú đầy màu sắc cùng với bãi biển xanh ngắt trải dài tới cuối chân trời. Có thể kể ra đảo Điệp Sơn gồm 3 đảo nhỏ, nằm trong vùng biển thuộc vịnh Vân Phong.
Từ cảng Cầu Đá bạn sẽ mất hơn một giờ đi tàu để đến Hòn Nội - một đảo yến thuộc Nha Trang. Nơi đây có bãi tắm đôi duy nhất ở Việt Nam với bãi cát trắng mịn, quay hướng nào bạn cũng nhìn thấy biển xanh ngắt một màu. Với những du khách ưa tĩnh lặng thì hòn Ông là hòn đảo tuyệt vời, hoang sơ không có người.
Nhưng nếu muốn lặn biển, ngắm san hô thì phải đến đảo Khỉ và hòn Mun. Thời điểm tốt cho chuyến lặn biển là từ tháng 4 đến tháng 7. Hòn Mun nằm cách Cầu Đá khoảng 10km. Nằm ở phía Đông Nam của đảo Bồng Nguyên, sẽ mất khoảng 45 phút đi tàu. Hòn Mun có tổng diện tích là 160 km², trong đó 122 km² là diện tích mặt biển, 38 km² là tổng diện tích của các hòn đảo.Nó được gọi là hòn Mun vì phía Đông Nam của đảo có những mõm đá nhô cao, vách dựng hiểm trở, tạo thành hang động, đặc biệt đá ở đây đen tuyền như gỗ mun, rất hiếm thấy ở những nơi khác. Để tham gia tour mạo hiểm này cần chuẩn bị nón mũ che nắng, sử dụng giày, dép thấp, hạn chế mang theo đồ điện tử.Trong những hang động đá đen của hòn Mun là nơi sinh sống và làm tổ của yến. Hệ sinh thái biển ở đây cũng vô cùng đa dạng, phong phú. Theo thống kê, hòn Mun có tới 1.500 loài san hô và sinh vật biển. Nước biển nơi đây trong xanh với vô vàn loài san hô đẹp. Việc được dịp lặn xuống biển và ngắm nhìn đáy đại dương thì còn gì tuyệt vời bằng. Đối với trẻ em nhỏ dưới 11 tuổi, người có tiền sử tim mạch, những người hay say tàu, xe không nên tham gia tour đầy mạo hiểm này.Các nhân viên cứu hộ sẽ hướng dẫn du khách chuẩn bị trang phục để đi lặn ngắm san hô (lặn nông), những đàn cá tung tăng dưới đáy biển. Du khách sẽ được hướng dẫn khởi động cơ thể khoảng chừng 5 phút trước khi xuống biển. Du khách sẽ được trang bị áo phao, kính lặn, ống thở, chân vịt (nếu muốn) để tự do bơi lội và lặn ngắm san hô, khám phá thế giới lung linh sắc màu dưới đáy đại dương.Với sức khỏe bình thường bạn có thể chinh phục độ sâu khoảng 20m, thời gian lặn khoảng 30 phút dưới lòng đại dương. Tất nhiên, các nhân viên cứu hộ sẽ phải liên tục không rời mắt theo dõi mọi động tĩnh đoàn khách của mình. Điều thú vị là bạn có thể chia sẻ những cảm giác khám phá biển có chút mạo hiểm này cùng bạn bè hay gia đình dưới đáy biển. Một trải nghiệm thú vị cho những ai thích khám phá đại dương sẽ là một kỉ niệm nhớ mãi mà không bao giờ quên được.Ở Nha Trang còn có một địa điểm khác có thể lặn biển ngắm san hô. Đó là đảo Khỉ, một đảo nhỏ nằm trong khu vịnh Nha Phu, gần ngay vịnh Ninh Vân xinh đẹp, và chỉ cách trung tâm TP Nha Trang 15km về phía Bắc. Để đến thăm đảo Khỉ, bạn phải đến bến tàu ở cảng Đá Chồng.Đảo có diện tích 25ha và cũng sở hữu rất nhiều cảnh đẹp cùng hơn 1.200 chú khỉ gồm nhiều giống loài khác nhau như khỉ mặt đỏ hay khỉ lông xám. Khỉ ở đây được nuôi thả tự nhiên trong các khu rừng nguyên sinh chứ không nuôi nhốt trong các chuồng trại. Nên trước khi lặn biển, bạn có thể vui đùa với những chú khỉ dễ thương, ngộ nghĩnh ở khắp mọi nơi trên đảo. Bãi biển hoang sơ, không có bàn tay can thiệp của con người, nước biển trong xanh và nhiều rặng san hô đẹp. Đây là nơi ẩn náu nhiều loại cá biển lạ và quý. Cũng vì điều đó mà thu hút sự tò mò của du khách khi muốn khám phá đại dương xanh.Ngoài hành trình lặn ngắm biển Nha Trang, du khách sẽ được đắm mình trong nắng gió biển trời, vùng vẫy trong làn nước trong xanh khi lên bờ ngồi thưởng thức những món hải sản tươi rói. Món ngon nổi tiếng ở Nha Trang có thể nhắc tới bào ngư nhỏ, tôm sấy, nghêu nướng bơ tỏi.
