UBND TP giao Sở Nội vụ chủ trì và phối hợp với các sở, ngành liên quan và Ban Quản lý Đường sắt đô thị Hà Nội tiến hành tổ chức tiếp nhận bàn giao tiền vốn, tài sản, đất đai, lao động, hồ sơ tài liệu cho Công ty TNHH MTV Đường sắt Hà Nội quản lý điều hành theo quy định. Trụ sở chính của Công ty được đặt tại khu Depot phường Phú Lương, quận Hà Đông.