Vào thời gian trên, tàu hàng số hiệu SH3 lưu thông hướng Hà Nội - Vinh, khi đến đường ngang dân sinh đã đâm vào xe bồn mang BKS: 37C-173.16 đang cố băng qua đường sắt.
Cú đâm ngang khiến chiếc xe bồn văng xoay dọc đường sắt. Tại hiện trường cabin xe tải nát, kính vỡ vung vãi, nằm sát cạnh đường ray. Do phía trước mũi tàu được trang bị cản trước để tránh va chạm nên chỉ bị cong vênh. Vụ tai nạn không làm lái tàu và lái xe tải bị thương nhưng khiến tuyến đường sắt Bắc - Nam tê liệt hơn 1 giờ đồng hồ. Đến 14h40, tàu SH3 tiếp tục hành trình và tuyến đường sắt lưu thông bình thường qua khu vực.Được biết, đoạn đường dân sinh nơi xảy ra tai nạn có biển báo nhưng do tài xế xe bồn thiếu quan sát, vượt ẩu nên tai nạn xảy ra. Đây là vụ tai nạn đường sắt thứ 4 trong vòng 3 ngày qua xảy ra tại các tỉnh miền Trung, và là vụ thứ 2 liên tiếp trong 2 ngày xảy ra trên địa bàn tỉnh Nghệ An.Trước đó, khoảng 16h30, ngày 26/5, tàu chở hàng chạy từ huyện Hương Khê (Hà Tĩnh) về thành phố Vinh (Nghệ An) khi đến ga Yên Xuân, huyện Hưng Nguyên, Nghệ An thì bị trật bánh. Vụ việc không gây thiệt hạ về người, nhưng khiến 2 toa tàu bị nghiêng khoảng 45 độ, một số đá trên toa văng xuống đất; gần 30m đường ray xiêu vẹo, nhiều thanh tà vẹt bị gãy.
