Chánh Thanh tra Bộ GD&ĐT Nguyễn Huy Bằng có kết luận: Trường CĐ ASEAN thông báo, tuyển sinh, tổ chức liên kết đào tạo liên thông từ trung cấp lên CĐ, cấp bằng chính quy ngành Dược với Trường Trung cấp Vạn Tường (TP HCM) và Trường Trung cấp Việt Anh (Nghệ An) với số lượng SV là 703 người. Việc liên kết đào tạo khi không được các cơ quan có thẩm quyền cho phép là vi phạm quy định tại Quyết định số 42/2008/QĐ-BGDĐT ngày 28/7/2012 quy định về liên kết đào tạo trình độ trung cấp chuyên nghiệp, CĐ, ĐH. Và, việc thông báo tuyển sinh và tổ chức đào tạo chính quy ngoài trường là vi phạm quy định tại Quyết định số 06/2008/QĐ-BGDĐT ban hành quy định đào tạo liên thông trình độ cao đẳng, đại học.
Chánh thanh tra khẳng định những vi phạm trên thể nhận thức pháp luật của Nhà trường trong việc tuyển sinh, đào tạo không đầy đủ, thái độ chấp hành pháp luật không nghiêm túc, cố ý thực hiện hành vi trái pháp luật nhiều lần, số lượng SV đã tuyển và đào tạo lớn. Khi các vi phạm bị phát hiện, Nhà trường đã báo cáo không trung thực; bất chấp các cảnh báo và xử phạt của Bộ GD&ĐT, thể hiện thái độ coi thường pháp luật và các cơ quan quản lý nhà nước, gây bức xúc trong dư luận xã hội.
Căn cứ vào các quyết định, thông tư của Bộ GD&ĐT, Nghị định số 49 của Chính phủ, Bộ GD&ĐT kết luận về xử lý các sai phạm. Cụ thể, yêu cầu Trường ASEAN chấm dứt mọi hoạt động tuyển sinh, đào tạo ngành Dược tại TP HCM, Nghệ An và các địa điểm khác ngoài trường (nếu có). Thanh tra Bộ tiến hành xử phạt vi phạm hành chính đối với hành vi vi phạm mới được phát hiện của Trường ASEAN với tình tiết tăng nặng; xử phạt vi phạm hành chính đối với Trường Trung cấp Việt Anh (Nghệ An).
Bộ GD&ĐT sẽ có văn bản gửi UBND TP HCM, UBND tỉnh Nghệ An, UBND tỉnh Hưng Yên về việc phối hợp xử lý sai phạm của các trường và tổ chức kiểm điểm trách nhiệm của những cá nhân thuộc trường liên quan đến sai phạm.
Trường CĐ ASEAN có trách nhiệm kiểm tra, rà soát cho thôi học, hoàn trả kinh phí cho những người không đủ điều kiện theo quy định về đối tượng đào tạo liên thông. Đồng thời đề xuất phương án khắc phục sai phạm cụ thể đối với người đủ điều kiện theo quy định về đối tượng đào tạo liên thông đang liên kết đào tạo trái phép và có văn bản báo cáo Bộ GD&ĐT trước ngày 30/5/2013. Trường có văn bản báo cáo Bộ GD&ĐT kết quả giải quyết quyền lợi cho người học đang đào tạo sai quy định trước ngày 30/6/2013.