Mức học phí được tính theo số tín chỉ học phí (TCHP) của các học phần được sinh viên đăng ký ở mỗi học kỳ. Đối với sinh viên học theo tiến độ bình thường, mỗi năm học tương đương khoảng 50 TCHP đối với các ngành Kỹ thuật công nghệ, khoảng 40 TCHP đối với ngành Kinh tế - quản lý và Ngôn ngữ Anh.
Theo đó, năm học 2017 – 2018, nhóm ngành Cơ điện tử, Điện – Điều khiển – Tự động hóa, Điện tử - Viễn thông, Công nghệ thông tin, Kinh tế - Quản lý, Ngôn ngữ Anh mức học phí 320.000 đồng/1 tín chỉ. Như vậy, học phí 1 năm học được quy ra 16 triệu đồng/1 năm (50 tín chỉ); riêng ngành Kinh tế - Quản lý, Ngôn ngữ Anh 12,8 triệu đồng/1 năm (40 tín chỉ).
Nhóm ngành Cơ khí động lực, Kỹ thuật hóa học, Sinh học – Thực phẩm, Kỹ thuật in, Môi trường 280.000 đồng/1 tín chỉ, tương đương 14 triệu đồng/1 năm học.
Nhóm ngành Toán tin, Vật lý kỹ thuật, Kỹ thuật hạt nhân, Nhiệt – Lạnh, học phí 260.000 đồng/1 tín chỉ, tương đương 13 triệu đồng/1 năm học.
Nhóm ngành Dệt – May, Vật liệu, Sư phạm kỹ thuật học phí 240.000 đồng/1 tín chỉ tương đương 12 triệu đồng/1 năm học.
Đối với các chương trình đào tạo đặc biệt, mức học phí cao hơn so với nhóm ngành ĐH đại trà. Chương trình tiên tiến Công nghệ thông tin Việt – Nhật 460.000 đồng/1 tín chỉ. Các chương trình tiên tiến Cơ điện tử; Điện tử - Viễn thông; Điều khiển, Tự động hóa và Hệ thống điện; Kỹ thuật Y sinh, Chương trình ICT và IPE 420.000 đồng/1 tín chỉ. Chương trình tiên tiến Khoa học và Kỹ thuật vật liệu 380.000 đồng/1 tín chỉ. Các chương trình Đào tạo tài năng và Kỹ sư chất lượng cao PFIEV 320.000 đồng/1 tín chỉ.
Mức học phí năm học 2018 – 2019 và 2019 – 2020, đối với các nhóm ngành đào tạo ĐH đại trà và chương trình đặc biệt sẽ tăng thêm 40.000 đồng/1 tín chỉ.
Theo lãnh đạo Trường ĐH Bách khoa Hà Nội, mức học phí đối với các ngành đào tạo ĐH đại trà đều thấp hơn mức trần do Thủ tướng Chính phủ quy định từ 20% đến 40%. Mức học phí bình quân cũng nằm dưới mức dự kiến Nhà trường đã công bố trong đề án được Chính phủ phê duyệt (14,4 triệu đồng so với dự kiến 16 triệu đồng so với năm học 2017 – 2018).
Cũng theo lãnh đạo Trường ĐH Bách khoa Hà Nội, nhà trường thực hiện đầy đủ chế độ miễn, giảm học phí cho sinh viên theo quy định của Nhà nước. Đồng thời, Nhà trường hỗ trợ toàn phần chênh lệch giữa mức học phí đào tạo ĐH đại trà của trường với mức học phí được miễn, giảm theo quy định của Nhà nước.
