Ngoài ra, còn có phế thải phát sinh từ quá trình nạo vét hệ thống thoát nước và xử lý nước thải của TP, ước khoảng 800.000 - 900.000 tấn bùn/năm. Tuy nhiên, hiện nay, trên địa bàn Hà Nội chưa có nhà máy xử lý, tái chế phế thải. Trong khi dự báo khối lượng chất thải rắn xây dựng và phế thải thoát nước trên địa bàn Hà Nội đến năm 2020 sẽ tăng lên nhanh chóng. Các loại phế thải xây dựng hiện nay chưa được tái chế; một lượng nhỏ được dùng để san lấp mặt bằng, còn lại phần lớn đem chôn lấp đổ lộ thiên gây ô nhiễm môi trường và mất cảnh quan đô thị, gây lãng phí tài nguyên thiên nhiên, đặc biệt là diện tích bãi chứa phế thải.