Năm 2001, Ban Quản lý Dự án phát triển chăn nuôi bò sữa được thành lập, với chức năng nhiệm vụ chính là tập trung phát triển chăn nuôi bò sữa. Sau 10 năm phát triển, từ chỗ tổng đàn bò sữa chỉ là 3.027 con, đến nay số lượng đã tăng lên 9.899 con với 2.799 hộ nuôi, quy mô bình quân 3,5 con/hộ. Sản lượng sữa bò tươi của toàn thành phố đạt 87,8 tấn/ngày, tăng 49,3% so với năm 2010, năng suất sữa đạt 4.400 kg sữa/chu kỳ 305 ngày.
Nổi bật về chăn nuôi bò sữa là đã xây dựng được các xã chăn nuôi trọng điểm là Yên Bài, Vân Hòa, Tân Lĩnh (huyện Ba Vì), Trung Mầu, Dương Hà, Phù Đổng (huyện Gia Lâm) Phượng Cách (Quốc Oai). Chỉ trong 3 năm (2009 - 2011), các địa phương này đã phát triển đàn bò sữa đạt 7.645 con, chiếm 77% tổng số đàn bò trên toàn Thành phố. Đời sống của người chăn nuôi bò sữa ngày càng được nâng cao.
Ngoài việc tập trung phát triển chăn nuôi bò sữa, Trung tâm còn thực hiện các giải pháp phát triển chăn nuôi bò thịt. Đến nay đã quy hoạch được 10 xã chăn nuôi bò thịt trọng điểm với 15.051 con bò thịt. Toàn thành phố có 56 trang trại chăn nuôi quy mô lớn ngoài khu dân cư với số lượng 971 con bò thịt, bò sinh sản.
