Thành lập năm 2008, trường THCS Nam Trung Yên đã có bước phát triển vượt bậc cả về quy mô học sinh, xây dựng cơ sở vật chất và xây dựng đội ngũ cán bộ quản lý, giáo viên. Đặc biệt, nhà trường đã chú trọng đổi mới phương pháp để nâng cao chất lượng và hiệu quả dạy học…
Trường đã được UBND Thành phố Hà Nội tặng Bằng khen về “Trường học thân thiện, học sinh tích cực” vì đã có nhiều sáng kiến trong các phong trào cũng những hoạt động giáo dục để phát triển toàn diện kĩ năng của học sinh.
