Theo nhận định của HĐXX phúc thẩm, năm 2007, bị cáo Đinh La Thăng - nguyên Chủ tịch HĐQT Tập đoàn Dầu khí Việt Nam (PVN) đã ký nghị quyết chấp thuận chủ trương đầu tư Nhà máy sản xuất Ethanol khu vực phía Bắc. Cuối năm 2007, Công ty CP Hoá dầu và nhiên liệu sinh học dầu khí (PVB) được thành lập làm chủ đầu tư dự án với vốn điều lệ ban đầu hơn 405 tỷ đồng.
Tháng 8/2008, PVB và Công ty CP Thiết kế Công nghiệp hoá chất (CECO) ký hợp đồng tư vấn lập dự án đầu tư xây dựng công trình và hồ sơ mời thầu. Tháng 2/2009, dự án được phê duyệt xây dựng tại huyện Tam Nông (tỉnh Phú Thọ) với tổng mức đầu tư hơn 1.300 tỷ đồng và thực hiện trong 18 tháng.
Tháng 9/2008, PVB mời sơ tuyển gói thầu xây dựng Nhà máy Ethanol Phú Thọ, trong đó có Liên danh PVC/Alfa Laval/Delta-T do PVC thành lập. Thực hiện chỉ đạo của bị cáo Thăng về việc chỉ định thầu, PVB không tổ chức đấu giá theo kế hoạch mà chuyển sang chỉ định thầu cho liên danh của PVC. Tháng 3/2013, PVC đơn phương dừng thi công dự án, chưa có hạng mục nào hoàn thành.
Dù biết PVC chưa từng thực hiện dự án nào về Ethanol và tình hình tài chính đang khó khăn, bị cáo Thăng đã chủ trì nhiều cuộc họp và "quyết liệt" định hướng giao thầu cho PVC như đề nghị của bị cáo Trịnh Xuân Thanh - nguyên Chủ tịch HĐQT, Tổng Giám đốc Tổng Công ty CP Xây lắp Dầu khí Việt Nam (PVC).
Bị cáo Thanh biết rõ, liên danh PVC/Alfa Laval/Delta-T không đủ năng lực thực hiện gói thầu nhưng vẫn nhận chỉ đạo từ lãnh đạo PVN để ký văn bản xin được chỉ định thầu. Đồng thời, bị cáo Thanh còn chủ trì cuộc họp HĐQT và ban Tổng Giám đốc PVC đồng ý thực hiện gói thầu; ký công văn gửi bị cáo Thăng xin cam kết thực hiện gói thầu. Các cơ quan tố tụng kết luận, hành vi làm trái của bị cáo Đinh La Thăng, Trịnh Xuân Thanh và các bị cáo dẫn đến thiệt hại cho PVB hơn 540 tỷ đồng.
HĐXX phúc thẩm nhận định, tại phiên toà phúc thẩm, các bị cáo kháng cáo xin giảm án, xin hưởng án treo và xin miễn bồi thường dân sự. Tuy nhiên các bị cáo không đưa ra được tình tiết, chứng cứ mới. Do đó, HĐXX của TAND cấp cao tại Hà Nội đã tuyên y án sơ thẩm về phần hình phạt và cả trách nhiệm dân sự với các bị cáo.
Cụ thể, bị cáo Vũ Thanh Hà - nguyên Tổng Giám đốc Công ty CP Hóa dầu và Nhiên liệu sinh học Dầu khí (PVB) mức án 6 năm 6 tháng tù; Phạm Xuân Diệu - nguyên Tổng Giám đốc PVC mức án 3 năm 6 tháng tù. Hai bị cáo Nguyễn Xuân Thủy - nguyên Phó Trưởng phòng Phòng đầu tư dự án PVB, Khương Anh Tuấn - nguyên Phó Trưởng phòng Phòng Thương mại PVB và Hoàng Đình Tâm - nguyên Kế toán trưởng PVB mỗi bị cáo 30 tháng. Riêng bị cáo Lê Thanh Thái - nguyên Trưởng phòng Phòng Kinh doanh PVB mức án 24 tháng tù và phải liên đới bồi thường.
Ngoài ra, HĐXX không chấp nhận kháng cáo của Công ty Mai Phương về việc yêu cầu trả lại 3.400m2 đất tại Tam Đảo (tỉnh Vĩnh Phúc) cho công ty này. Trước đó, tại phiên toà ngày 28/9, đại diện của Công ty Mai Phương xin phép được nộp ngay 13 tỷ đồng để bồi thường thay cho Trịnh Xuân Thanh và khắc phục hậu quả cho PVC.
