Các bị can bị đề nghị truy tố gồm: Nguyễn Công Hoàng (SN 1959), nguyên Phó Tổng giám đốc Tổng công ty Cà phê Việt Nam kiêm Giám đốc Trung tâm XNK; Phạm Trung Tuyến (SN 1956), nguyên Giám đốc Trung tâm XNK và Võ Quang Vinh (SN 1986), nguyên Phó phòng phụ trách Phòng Tài chính kế toán Trung tâm XNK. Kết quả điều tra đã làm rõ hành vi cố ý làm trái quy định của Nhà nước về quản lý kinh tế gây hậu quả nghiêm trọng của các bị can. Theo đó, cơ quan điều tra đã làm rõ hành vi của Nguyễn Công Hoàng và Phạm Trung Tuyến trong việc ứng 2 tỷ đồng để chi hoa hồng cho khách hàng, gây thiệt hại cho Tổng công ty 1,95 tỷ đồng. Cụ thể, đối tượng Tuyến và Hoàng từ năm 2010 đến năm 2011 đã lập các chứng từ khống để rút và sử dụng riêng 2 tỷ đồng; khai chi hoa hồng nhưng không hoàn được đầy đủ chứng từ, hiện mới chỉ thu hồi được 50 triệu đồng. Kết luận điều tra còn nêu rõ hành vi sai phạm của Phạm Trung Tuyến và Võ Quang Vinh đã làm thất thoát hàng chục tỷ đồng. Cụ thể, từ tháng 9/2011 - tháng 6/2012, Tuyến và Vinh đã lập hồ sơ khống, ký 5 hợp đồng mua 1.000 tấn cà phê của Công ty TNHH TMDV nông sản Bắc Hà (Công ty Bắc Hà), rồi sử dụng hồ sơ này vay hơn 854.000 USD tại Techcombank chi nhánh TP Hồ Chí Minh với lãi suất 8,5% để chuyển cho Công ty Bắc Hà vay lại với lãi suất 21%/năm. Đến thời hạn hoàn trả ngân hàng, do chưa thu hồi được số tiền từ Công ty Bắc Hà, Tuyến đã chỉ đạo Vinh sử dụng tiền của các hợp đồng kinh tế khác để hoàn trả. Hậu quả đã không thu hồi được tài sản, gây thiệt hại cho Tổng công ty hơn 18 tỷ đồng. Cũng với thủ đoạn lập khống hợp đồng, từ tháng 9/2011 - 2/2012, Tuyến và Vinh đã sử dụng vốn kinh doanh của Trung tâm XNK chuyển cho Công ty TNHH Hoàng Đạo, gây thiệt hại cho Tổng công ty hơn 17 tỷ đồng.