Theo các quy định hiện hành, xe máy điện NK phải chịu mức thuế suất thuế NK ưu đãi là 60%, thuế suất thuế GTGT là 10%. Trường hợp tổ chức, cá nhân NK xe từ nước ngoài không kê khai nộp các khoản thuế trên, cơ quan hải quan ấn định thuế để truy thu đủ số tiền thuế phải nộp. Tuy nhiên, theo phản ánh của Cục CSGT, phần lớn số xe máy điện hiện nay người dân đang sử dụng là xe nhập lậu từ Trung Quốc, không kê khai hải quan, nên không có các chứng từ theo quy định về nguồn gốc của xe, hóa đơn, lệ phí trước bạ để được đăng ký, cấp biển số. Do đó, nếu xử lý truy thu thuế số lượng rất lớn xe máy điện đang lưu hành là khó khả thi. Do đó, Cục CSGT đã đề xuất phương án miễn truy thu thuế NK, thuế GTGT, hóa đơn bán xe đối với xe máy điện đã được mua sử dụng đến hết ngày 31/12/2015.