Kết quả chung cuộc, Đoàn thể thao người khuyết tật Việt Nam (TTNKT VN) tham dự với 124 VĐV, tranh tài ở 6 môn thể thao là điền kinh, bơi lội, cử tạ, bóng bàn, cầu lông, cờ vua, giành tổng cộng 160 tấm huy chương, trong đó có 44 HCV, 44 HCB và 72 HCĐ, qua đó xếp hạng 4 toàn đoàn sau Thái Lan 290 huy chương (125 HCV, 94 HCB, 71 HCĐ), chủ nhà Indonesia 289 huy chương (107 HCV, 99 HCB, 83 HCĐ) và Malaysia 126 huy chương (50 HCV, 34 HCB, 42 HCĐ).
Trong 6 môn mà đoàn Việt Nam tham gia đều giành huy chương, duy chỉ có môn cờ vua không có HCV. Trong số đó, bơi là môn gặt hái nhiều thành công nhất với 18 HCV, 20 HCB và 8 HCĐ. Ở Đại hội lần này, đoàn VN không đạt được số lượng HCV như mong muốn (khoảng 70 HCV). Tuy nhiên, xét về chuyên môn, các VĐV VN đã thi đấu hết sức thành công khi phá ba kỷ lục châu Á cùng 33 kỷ lục ASEAN Para Games. Những gương mặt xuất sắc là Võ Thanh Tùng (đoạt 2 HCV, 1 HCB, đạt ba chuẩn A tham dự Paralympic và phá hai kỷ lục châu Á - ASIAN Para Games), Võ Huỳnh Anh Khoa (giành 3 HCV bơi lội, đồng thời phá 3 kỷ lục Para Games), Nguyễn Thị Hải (đoạt 3 HCV môn điền kinh, phá 3 kỷ lục Para Games ở 3 nội dung ném lao, đẩy tạ và ném đĩa mà cô tham dự). Đây là thành quả rất đáng khích lệ trong bối cảnh TTNKT VN không được đầu tư mạnh so với nhiều nước trong khu vực.
Đặc biệt, không như Đại hội (ĐH) lần trước ở Malaysia khi các đoàn được bố trí ở khách sạn tiện nghi, năm nay, thành viên các đoàn được bố trí ở tại làng VĐV Kompleks Haji. Do có quá đông người nên dẫn đến tình trạng phải ở ghép, gây nhiều bất tiện trong lịch nghỉ ngơi, thi đấu. Điều kiện thiết bị sinh hoạt cũng thiếu thốn. Tuy được ăn tự chọn nhưng BTC chỉ phục vụ chủ yếu ba món gồm rau xào, xúc xích và thịt gà đều được chế biến theo kiểu Indonesia nên nhiều VĐV không hợp khẩu vị. Do đó, thức ăn chủ yếu của nhiều VĐV VN là mì gói, thịt hộp, lương khô mang theo. Chính vì thế, thành tích của đoàn Việt Nam ở ĐH lần này là rất đáng trân trọng và ngợi khen.
Toàn Đại hội có 302 kỷ lục mới được thiết lập. Tuy nhiên, theo thông báo của Ủy ban Paralympic quốc tế (IPC), thành tích thi đấu của các VĐV tại ASEAN Paragames 2011 sẽ không được tính chuẩn để xét vé tham dự Paralympic London 2012. Đó là do điều kiện, trang thiết bị, sân bãi mà nước chủ nhà Indonesia tổ chức thi đấu không đáp ứng đúng tiêu chuẩn như quy định. Việc mời trọng tài, giám sát quốc tế từ IPC cũng không được nước chủ nhà tuân thủ
Tuy không được Ủy ban Paralympic quốc tế công nhận nhưng việc các VĐV VN đạt thành tích dự Paralympic London 2012 (9 chuẩn A và 23 chuẩn B) sẽ giúp việc chọn VĐV để đầu tư lấy vé đến London 2012 cũng trở nên dễ dàng hơn.