KKT Nam Phú Yên có 3 trung tâm phát triển chính, 6 phân khu chức năng
Kinhtedothi – Khu kinh tế Nam Phú Yên có tổng diện tích khoảng 20.730 ha. Khu vực này được định hướng phát triển với 3 trung tâm phát triển chính là trung tâm đô thị sân bay; trung tâm đô thị Hòa Vinh và trung tâm đô thị thương mại ven biển và 6 phân khu chức năng.