Sở Công Thương Hà Nội cho biết, việc nhân rộng mô hình này đang gặp khó khăn do UBND các quận, huyện còn chưa quan tâm nên đến nay chưa xác định được 19 dự án chợ ATTP theo yêu cầu của UBND TP. Bên cạnh đó, cơ sở vật chất tại các chợ còn kém. Một số chợ đã bị xuống cấp nghiêm trọng ảnh hưởng đến việc đảm bảo ATTP và công tác chuyển đổi chợ.