Các bị can Dương Tự Trọng, Trần Văn Dũng (ở Hải Phòng); Vũ Tiến Sơn, nguyên Phó Trưởng phòng Cảnh sát hình sự Công an Hải Phòng; Ðồng Xuân Phong (nguyên cán bộ Hải quan Hải Phòng)... bị cáo buộc có hành vi tổ chức cho ông Dương Chí Dũng (anh trai ông Dương Tự Trọng), nguyên Chủ tịch HÐQT Vinalines, nguyên Cục trưởng Cục Hàng hải Việt Nam trốn đi nước ngoài. Quá trình điều tra mở rộng vụ án, CQÐT đã khởi tố một vụ án độc lập khác để điều tra hành vi lợi dụng chức vụ quyền hạn trong khi thi hành công vụ của ông Dương Tự Trọng.