Hiện tình hình hoạt động của các HTX ở cả 4 địa phương trên đều gặp nhiều khó khăn, chưa gắn với Ban Chỉ đạo NTM, chưa phân công nhiệm vụ cụ thể cho HTX; đề án củng cố, phát triển HTX chưa được cấp có thẩm quyền phê duyệt để các cấp, các ngành chỉ đạo, hỗ trợ trong quá trình thực hiện… Qua 2 năm củng cố, đã có một số HTX vươn lên hoạt động hiệu quả. Trong năm 2011, Hà Nội đã củng cố thành công 11 HTX tại 11 xã điểm xây dựng NTM. Năm 2012, Liên minh HTX TP tiếp tục tư vấn, hướng dẫn củng cố 8 HTX tại 8 xã xây dựng NTM.