Trong đó, thực tế hỗ trợ sai đối tượng nhưng không bộ, ngành nào chịu trách nhiệm đã được chỉ ra.
Nghị định 116 đã quy định 7 chế độ đối với cán bộ, công chức, viên chức và người hưởng lương trong lực lượng vũ trang công tác ở vùng có điều kiện kinh tế - xã hội đặc biệt khó khăn. Tuy vậy trong quá trình thực hiện, do không có quy định cụ thể, nên vẫn xảy ra tình trạng một số địa phương đã thực hiện chính sách không đúng đối tượng. Theo Phó Chủ tịch Hội đồng Dân tộc Nguyễn Lâm Thành, qua báo cáo của các cơ quan có liên quan và khảo sát trực tiếp tại 10 tỉnh đại diện cho các khu vực, địa bàn, Hội đồng Dân tộc nhận thấy trong quá trình triển khai Nghị định 116 cũng đã phát hiện nhiều hạn chế, trong đó nổi lên vấn đề thiếu tính thống nhất về phạm vi điều chỉnh và đối tượng áp dụng ngay trong Nghị định này. Cụ thể Nghị định 116 cũng quy định đối tượng thụ hưởng bao trùm lên rất nhiều đối tượng đã được quy định bởi các chính sách trước đó, nhưng không bãi bỏ các chính sách trước hoặc không hướng dẫn cụ thể nên việc chi trả khác nhau, có nơi chi trả cùng lúc nhiều chính sách cho một đối tượng, có nơi lại chỉ thực hiện một chính sách.
Các ĐB khác cũng chi ra có nơi chi cả 3 chế độ nhưng có nơi có người nằm trong đối tượng nhưng chưa được hưởng. Nhưng trách nhiệm lại chưa được chỉ rõ. Việc thực hiện chính sách chưa thống nhất tạo sự bất công bằng khi cán bộ không muốn đi khỏi xã thuộc đối tượng thụ hưởng chính sách và người nơi khác lại muốn chạy về nên dẫn đến cơ chế xin - cho.
Giải trình thêm, Bộ trưởng Bộ Nội vụ Lê Vĩnh Tân thừa nhận, hiện có tới 3 văn bản của Chính phủ quy định về chính sách đối với cán bộ, công chức, viên chức và lực lượng vũ trang công tác ở vùng có điều kiện kinh tế - xã hội đặc biệt khó khăn. Việc quy định cùng một chính sách ở nhiều văn bản và ở các thời gian khác nhau gây khó khăn cho cơ quan, đơn vị trong việc áp dụng chính sách. Trước tình trạng trên, Bộ Nội vụ đã đề nghị Chính phủ ban hành Nghị định mới thay thế cho 3 Nghị định trên. Bộ Nội vụ cũng đề xuất Chính phủ giao Bộ LĐTB&XH trình Thủ tướng Chính phủ phê duyệt danh sách xã đặc biệt khó khăn vùng bãi ngang, ven biển và hải đảo.
