Trong giai đoạn 2009 - 2011 đã bố trí 1.133 tỷ đồng cho dự án. Tuy nhiên, đến nay không có chủ trương bổ sung nguồn vốn trái phiếu Chính phủ thực hiện Chương trình nhà ở sinh viên, vì vậy, Bộ KH&ĐT đề nghị UBND TP Hà Nội huy động nguồn vốn địa phương và các thành phần kinh tế khác để hoàn thành dự án.
Trước yêu cầu của Bộ KH&ĐT, ngày 31/5, UBND TP Hà Nội đã có văn bản giao Sở Xây dựng chủ trì phối hợp với Sở KH&ĐT, Tài chính rà soát, sắp xếp thứ tự ưu tiên và thực hiện chuyển đổi hình thức đầu tư đối với các dự án có khả năng huy động các nguồn vốn khác. Từ đó tổng hợp báo cáo UBND TP xem xét thống nhất với Bộ Xây dựng, KH&ĐT, Tài chính báo cáo Thủ tướng Chính phủ chỉ đạo thực hiện dứt điểm trong quý II/2013.