Năm 2016, huyện Mỹ Đức chịu ảnh hưởng của cơn bão số 1, cơn bão số 3 và một số đợt mưa lớn. Bão số 1 làm tốc mái 37 nhà dân, 2 trường học, hơn 1.000 cây xanh bị gẫy đổ, 200ha rau màu dập nát và 100ha lúa bị úng. Bão số 3 khiến nước từ rừng ngang đổ về làm mực nước hồ Quan Sơn - Tuy Lai lên nhanh tràn vào đê. Các đợt mưa lớn gây úng ngập cục bộ một số diện tích lúa, làm sạt lở 30m kè mương tiêu chính giáp đường giao thông liên thôn xã Phùng Xá, sạt lở 10m đê Quan Quốc xã Phúc Lâm. Đáng chú ý, lượng mưa lớn làm mực nước sông Đáy, sông Bùi lên cao kéo dài gây sạt lở 600m theo bờ của 2 sông đoạn qua địa phận xã Phúc Lâm.
Ban Chỉ huy PCTT-TKCN huyện Mỹ Đức đã kịp thời thực hiện các phương án trước, trong và sau khi mưa bão xảy ra, giảm thiểu tối đa thiệt hại do mưa bão gây ra. Tiến hành nạo vét, khơi thông dòng chảy hệ thống kênh mương, lắp bổ sung các trạm bơm dã chiến đảm bảo tiêu úng cho diện tích sản xuất lúa, hoa màu. Kiểm tra, đôn đốc các xã, thị trấn thực hiện phương án PCTT-TKCN theo phương châm “4 tại chỗ, 2 kết hợp” nhằm chủ động đối phó với các tình huống úng, ngập xảy ra. Đồng thời, phát hiện và xử lý kịp thời các sự cố sạt lở dọc bờ sông Bùi, sông Đáy, thực hiện tốt việc huy động nhân lực, vật tư, phương tiện bảo vệ đê và tài sản của người dân.Phó Chủ tịch UBND huyện Mỹ Đức Đặng Văn Triều cho biết, trước tình hình thời tiết 2017 có nhiều diễn biến phức tạp, huyện đã yêu cầu các xã, thị trấn tuyệt đối không chủ quan mà cần chủ động xây dựng kế hoạch, phương án PCTT-TKCN cụ thể, sát thực tế. Cùng với đó, làm tốt công tác tuyên truyền để người dân hiểu rõ tầm quan trọng của bảo vệ đê điều, công trình thủy lợi. Phối hợp với các đơn vị chức năng của huyện tiến hành kiểm tra, đánh giá hiện trạng đê điều, công trình thủy lợi, hồ đập trước mùa mưa bão nhằm hoàn thành sớm phương án phòng hộ, khắc phục hậu quả phục hồi sản xuất.Tại hội nghị, UBND huyện Mỹ Đức đã công bố các Quyết định: Kiện toàn Ban Chỉ huy PCTT; Phân công nhiệm vụ các thành viên Ban Chỉ huy PCTT; Thành lập các Tiểu ban thuộc Ban Chỉ huy PCTT; Phê chuẩn lực lượng điếm canh đê phục vụ công tác PCTT; Thành lập đội giao thông hỏa tốc PCTT năm 2017.