Theo lãnh đạo xã Ninh Hiệp, việc vi phạm trật tự xây dựng tại đây gây bức xúc trong dư luận cán bộ, đảng viên và người dân, ảnh hưởng đến cảnh quan sư phạm trường học. Đến ngày 4/4/2014, việc khắc phục vi phạm về trật tự xây dựng tại trường THCS Ninh Hiệp đã được UBND xã, chủ đầu tư, đơn vị thi công đã phá dỡ 9/12 gian nhà trong trường, trả lại mặt bằng hiện trạng ban đầu; còn 3 gian, trường đề nghị giữ lại làm nhà kho. Mặc dù, qua sự việc vi phạm này, cả lãnh đạo nhà trường và xã đều đã rút kinh nghiệm, kỷ luật đối với người chịu trách nhiệm. Tuy nhiên, theo Trưởng Ban Pháp chế HĐND TP Nguyễn Hoài Nam, việc xử lý khắc phục sai phạm của UBND xã còn chậm và cần tiếp tục làm rõ chủ trương xã hội hóa, trách nhiệm của phòng giáo dục, phòng TN&MT huyện Gia Lâm khi phê duyệt chủ trương đầu tư... Đồng thời cho rằng: Xã Ninh Hiệp đang là địa bàn "nóng" về quản lý đất đai, rút kinh nghiệm từ vụ việc vi phạm tại trường THCS Ninh Hiệp, chính quyền xã phải hết sức thận trọng, nắm chắc tình hình và công khai minh bạch trong tổ chức thực hiện quy hoạch, tạo điều kiện cho người dân tham gia đóng góp ý kiến.