Đồng thời lên phương án thiết kế xây dựng cầu vượt qua nút giao này. Theo đó, để xây dựng cầu vượt, nút giao Chùa Bộc - Phạm Ngọc Thạch sẽ được mở rộng, cầu Trung Tự gần đó cũng được mở rộng kết hợp chỉnh trang đường Phạm Ngọc Thạch. Dự kiến, cầu vượt kết cấu thép sẽ được xây dựng theo hướng Chùa Bộc - Phạm Ngọc Thạch với chiều dài 270m, mặt cắt ngang khoảng 9 - 12 m. Tổng mức đầu tư ước tính khoảng 169 tỷ đồng.