Một trong những điểm đáng lưu ý trong đề xuất này là mức xử phạt đối với chủ phương tiện chậm nộp phí. Cụ thể, Cục Đăng kiểm Việt Nam đề xuất, đối với các phương tiện chậm nộp phí từ một tháng trở lên đến 12 tháng thì sẽ phải nộp phí bằng 105% mức phí hàng tháng nhân với số tháng chậm nộp; Đối với các phương tiện chậm nộp phí từ trên 12 - 24 tháng sẽ phải nộp phí bằng 108% mức phí hàng tháng nhân với số tháng chậm nộp; Đối với các phương tiện chậm nộp phí từ trên 24 tháng thì sẽ phải nộp phí bằng 115% mức phí hàng tháng nhân với số tháng chậm nộp.