Theo Quy chuẩn kỹ thuật Quốc gia về yêu cầu kỹ thuật đối với cơ sở sản xuất giống và nuôi cá rô phi, bờ ao nuôi cá rô phi phải đảm bảo không bị rò rỉ, độ sâu mực nước tối thiểu 1,5m. Khu ao xử lý nước thải, chứa bùn thải cần phải tách biệt với ao nuôi, có diện tích tối thiểu 10% tổng diện tích mặt nước nuôi của cơ sở nuôi. Khu chứa nguyên vật liệu có mái che, được ngăn riêng biệt cho từng loại nguyên vật liệu và có biện pháp ngăn chặn côn trùng và động vật gây hại. Thức ăn, thuốc thú y thủy sản và sản phẩm xử lý, cải tạo môi trường sử dụng trong quá trình nuôi được đặt trên kệ hoặc giá treo, cách tường nhà và nền nhà ít nhất 0,3m. Bên cạnh đó, quy chuẩn cũng quy định thức ăn công nghiệp sử dụng trong quá trình nuôi phải được phép lưu hành tại Việt Nam, có nhãn hàng hóa đầy đủ theo quy định về ghi nhãn hàng hóa, không sử dụng thức ăn ôi thiu, ẩm mốc và hết hạn sử dụng. Thuốc thú y thủy sản và sản phẩm xử lý, cải tạo môi trường dùng cho việc phòng, trị bệnh cá, xử lý, cải tạo môi trường phải được phép lưu hành tại Việt Nam, không sử dụng thuốc đã hết hạn sử dụng.Đặc biệt, khi cá nuôi mắc bệnh, người nuôi không được xả nước, chất thải từ ao nuôi có cá mắc bệnh chưa được xử lý hoặc vứt bỏ cá chết, cá mắc bệnh ra môi trường xung quanh. Sau khi thu hoạch hoặc tiêu hủy cá bị bệnh, người nuôi phải khử trùng nước trong ao và các thiết bị, dụng cụ. Ngoài ra, người nuôi cần ghi chép và lưu giữ hồ sơ tối thiểu là 1 năm. Thông tư này có hiệu lực kể từ ngày 10/12/2017.