Cụ thể, HNE bị phạt 300 triệu đồng do đăng ký giao dịch chứng khoán quá thời hạn trên 12 tháng. Công ty cổ phần Hanel được cổ phần hóa từ doanh nghiệp nhà nước theo hình thức đấu giá tại Sở giao dịch chứng khoán Hà Nội vào ngày 20/4/2016. Nhưng đến 31/12/2019, sau một thời gian làm thủ tục, Công ty mới được Sở giao dịch chứng khoán Hà Nội chấp thuận đăng ký giao dịch.
Ngày 20/4/2016, HNE đã tổ chức phiên IPO đầu tiên với hơn 19,13 triệu cổ phiếu, giá chào bán khởi điểm 10.000 đồng/cổ phiếu, nhưng kết quả không mấy thành công, khi chỉ có gần 3,9 triệu cổ phiếu được mua với giá bình quân chỉ hơn 10.003 đồng/cổ phiếu.
Hiện tại, cơ cấu cổ đông của Hanel có UBND TP Hà Nội chi phối lớn, với tỷ lệ sở hữu 97,83%, tương đương hơn 188,6 triệu cổ phiếu.
Ngày 13/2, cổ phiếu HNE đã có phiên giao dịch đầu tiên trên UpCoM với giá tham chiếu 10.900 đồng/cổ phiếu và đã tăng mạnh liên tiếp 2 phiên sau đó, lần lượt 14,7% và 8%, nhưng thanh khoản thấp. Trong 3 phiên đầu tuần mới này, cổ phiếu HNE chững lại và đóng cửa phiên 19/2 tại 13.600 đồng/cổ phiếu.
Đáng chú ý, giữa năm 2019, HNE có khoản chi phí xây dựng cơ bản dở dang hơn 1.015 tỷ đồng, trong đó đáng kể là 962 tỷ đồng tại Dự án Khu công viên Công nghệ phần mềm Hà Nội.
Cùng với đó là gần 50 tỷ đồng tại Dự án Phạm Hùng (Toàn tháp TMĐT và VP Hanel). Hiện tại, HNE đã nộp tiền sử dụng đất gần 39 tỷ đồng cho diện tích tại lô 2 - E9 - Phạm Hùng - Hà Nội (thuộc dự án Đầu tư xây dựng trụ sở HNE).
Nhưng theo thông báo ngày 12/7/2019 của UBND TP Hà Nội về việc điều chỉnh phương án sắp xếp lại, xử lý nhà, lô đất trên của HNE không thuộc phạm vi sắp xếp lại theo Nghị định 167/2017 của Chính phủ.