Tính đến trưa 3/7, toàn tỉnh có 5 con trâu bị sét đánh chết. Cụ thể, sét đánh chết 2 con trâu của gia đình anh Đặng Văn Bành, thôn Thâm Quảng, xã Đường Âm (Bắc Mê); 3 con trâu của gia đình bà Triệu Thị Tịch và hộ ông Trương Văn Huyện, thôn Ngần Thượng, xã Tân Thành (Bắc Quang). Ngoài ra, tại xã Phú Nam (Bắc Mê) có 11 điểm sạt lở với khối lượng đất, đá ước khoảng 1.100 m3. Tại huyện Bắc Quang, mưa lớn làm sập đổ 15m tường bao của Trạm y tế xã Tân Thành; sạt taluy dương tại Km 3, tuyến tỉnh lộ 177, đoạn qua địa bàn xã Tân Lập với khối lượng sạt lở khoảng 300m3, gây ách tắc giao thông; nước lũ dâng cao gây ngập úng 2 điểm tuyến đường liên thôn Bản Buốt ra thôn Nặm Tuộc (xã Đồng Tâm), trong đó, điểm ngập sâu nhất là 0,8 m. Hiện tại, nước lũ đang dâng cao, gây ngập úng nhiều điểm, ảnh hưởng tới nhà ở của các hộ dân thuộc 6 thôn trên địa bàn xã Tân Quang và thôn Tân Mỹ (xã Việt Vinh).
Riêng tại huyện Vị Xuyên, trên 230 ha lúa mới cấy bị ngập úng, tập trung nhiều nhất tại xã Trung Thành, Linh Hồ, Việt Lâm. Ngoài ra, nhiều tuyến đường bị ngập úng cục bộ, một số điểm bị sạt lở, 1 cầu cứng tại xã Việt Lâm bị hư hỏng.
Mực nước sông Lô dâng cao, một số tuyến đường như Lý Tự Trọng, đoạn qua tổ 2, phường Trần Phú; tổ 11, phường Minh Khai (thành phố Hà Giang) bị ngập úng cục bộ, gây ảnh hưởng đến việc tham gia giao thông và nhà ở của người dân.
Ngay sau khi xảy ra thiên tai, Ban Chỉ huy phòng, chống thiên tai và tìm kiếm cứu nạn các địa phương đã phân công thành viên xuống nắm bắt tình hình và hướng dẫn nhân dân các biện pháp khắc phục.