Để khắc phục tình trạng phương tiện thủy trốn đăng kiểm, Cục đã đưa ra nhiều giải pháp, thậm chí điều cả đăng kiểm viên đến tận nơi khách hàng yêu cầu để kiểm định, nhưng nhiều chủ tàu vẫn không đăng kiểm. Do đó, để đảm bảo ATGT đường thủy, Cục Đăng kiểm Việt Nam đề nghị chính quyền các địa phương quản lý chặt đăng ký để xác định nguồn gốc phương tiện, kiểm soát chặt các cảng, bến thủy, tránh để xảy ra tình trạng phương tiện hoạt động tại các cảng, bến không phép hoặc quá hạn đăng kiểm vẫn ra, vào các cảng, bến.