Theo đó, sửa đổi mức thuế suất thuế nhập khẩu đối với mặt hàng urê, có hoặc không ở trong dung dịch nước từ 3% lên 6%. Điều chỉnh này của Bộ Tài chính được đưa ra nhằm tháo gỡ khó khăn cho hoạt động sản xuất, kinh doanh phân bón trong nước theo đề nghị của Tập đoàn Hóa chất Việt Nam và được sự đồng thuận của các cơ quan quản lý liên quan. Trước đó, giữa tháng 7-2014, Tập đoàn Hóa chất Việt Nam đã đưa ra đề xuất tăng thuế nhập khẩu một số mặt hàng phân bón, trong đó có urê. Tập đoàn này cho biết: Lượng phân bón urê nhập khẩu cuối năm 2013 và đầu năm 2014 tăng mạnh so với cùng kỳ trong khi sản lượng urê của 4 nhà máy trong nước đã dư khoảng 300.000 tấn/năm. Ngoài ra, Nhà máy sản xuất phân đạm urê của Tập đoàn tại Ninh Bình công suất 560.000 tấn/năm mới đi vào hoạt động từ cuối năm 2012 nên các chi phí khấu hao, lãi vay chiếm tỷ trọng rất lớn trong giá thành sản phẩm. Hơn nữa, than nguyên liệu chiếm tỷ trọng lớn nhất trong giá thành sản phẩm phải mua với giá cao hơn rất nhiều so với giá được tính toán trong dự án đầu tư trình Thủ tướng Chính phủ quyết định vào tháng 12-2007 trong khi giá bán urê tăng không đáng kể. Do đó, Tập đoàn Hóa chất Việt Nam đề xuất tăng thuế suất thuế nhập khẩu urê từ mức 0-4,5% lên mức chung là 7%. Tuy nhiên, theo Bộ Tài chính, thuế nhập khẩu của mặt hàng urê đã được điều chỉnh tăng từ 0% lên 3% áp dụng từ 1-1-2014 (Thông tư số 164) để khuyến khích sản xuất phân urê. Số liệu thống kê của Tổng cục Hải quan cho thấy, lượng phân bón urê nhập khẩu 4 tháng đầu năm 2014 là 24,958 tấn, giảm 69% về lượng và 72% về trị giá so với cùng kỳ năm 2013. Như vậy, việc điều chỉnh tăng thuế nhập khẩu urê lên 3% đã góp phần làm cho lượng urê nhập khẩu giảm. Mặt hàng phân urê trong nước đã sản xuất được, khả năng đáp ứng nhu cầu đang dần được cải thiện. Tuy nhiên, theo thông tin của Tập đoàn Hóa chất Việt Nam, lượng phân urê tồn kho đang tồn 138 nghìn tấn, tăng gần 900% so với năm 2013 Do vậy, để tháo gỡ khó khăn cho hoạt động sản xuất, kinh doanh mặt hàng này, Bộ Tài chính quyết định tăng gấp đôi thuế suất thuế nhập khẩu urê (6%-bằng với mức trần cam kết WTO) Mức thuế suất mới được áp dụng bắt đầu từ 10-9-2014.
